Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ms4a8Q99N10 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a8Q99N10 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms