Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PtprtQ99M80 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PtprtQ99M80 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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