Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms