Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Slc8b1Q925Q3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Slc8b1Q925Q3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Slc8b1Q925Q3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Slc8b1Q925Q3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Slc8b1Q925Q3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Slc8b1Q925Q3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Slc8b1Q925Q3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Slc8b1Q925Q3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Slc8b1Q925Q3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Slc8b1Q925Q3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc8b1Q925Q3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms