Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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