Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms