Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms