Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc12Q8K2L8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms