Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Brd3Q8K2F0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms