Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Neurl3Q8CJC5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms