Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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