Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms