Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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