Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Atg4dQ8BGV9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Atg4dQ8BGV9 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Atg4dQ8BGV9 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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