Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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