Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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