Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms