Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg2Q61878 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg2Q61878 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms