Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cd47Q61735 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cd47Q61735 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cd47Q61735 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cd47Q61735 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms