Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms