Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm28047Q3US59 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms