Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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