Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Arfgef3Q3UGY8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Arfgef3Q3UGY8 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Arfgef3Q3UGY8 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms