Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Parp8Q3UD82 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms