Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ctdnep1Q3TP92 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ctdnep1Q3TP92 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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