Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms