Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cers3Q1A3B0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms