Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms