Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ebf1Q07802 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms