Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MestQ07646 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MestQ07646 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MestQ07646 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MestQ07646 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MestQ07646 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms