Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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