Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms