Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms