Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms