Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cux2P70298 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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