Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ufm1P61961 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms