Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VtnP29788 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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