Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RxraP28700 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RxraP28700 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RxraP28700 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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