Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RarbP22605 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RarbP22605 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RarbP22605 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms