Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P20040 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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