Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CtsdP18242 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms