Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa-rs1P17533 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms