Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms