Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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RhoP15409 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RhoP15409 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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RhoP15409 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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RhoP15409 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms