Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms