Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms