Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01662 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01662 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01662 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01662 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01662 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01662 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01662 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms