Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms