Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Smim22J3QP37 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Smim22J3QP37 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms