Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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